Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P58686 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P58686 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms