Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dpf3P58269 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms