Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cd38P56528 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd38P56528 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms