Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtswP56203 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtswP56203 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtswP56203 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtswP56203 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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