Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PctpP53808 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PctpP53808 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PctpP53808 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PctpP53808 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms