Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RabggtbP53612 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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