Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lbx1P52955 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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