Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Upp1P52624 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms