Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa11P50709 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms