Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FmodP50608 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FmodP50608 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
FmodP50608 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
FmodP50608 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FmodP50608 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms