Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SftpbP50405 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpbP50405 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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