Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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