Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfx2P48379 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms