Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pik3caP42337 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pik3caP42337 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms