Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VhlP40338 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VhlP40338 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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