Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ly6dP35459 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms