Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SsbP32067 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SsbP32067 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SsbP32067 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SsbP32067 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SsbP32067 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms