Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
DesP31001 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DesP31001 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DesP31001 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms