Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VtnP29788 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VtnP29788 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VtnP29788 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms