Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp3P28862 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms