Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RxraP28700 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RxraP28700 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RxraP28700 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RxraP28700 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RxraP28700 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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