Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atxn10P28658 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn10P28658 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms