Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xrcc5P27641 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Xrcc5P27641 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc5P27641 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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