Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms