Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nfkb1P25799 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms