Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Znf239P24399 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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