Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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