Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms