Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms