Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpl13aP19253 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms