Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cxcl9P18340 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl9P18340 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl9P18340 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl9P18340 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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