Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp53P15975 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms