Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Irf1P15314 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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