Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calb1P12658 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms