Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms