Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP11369 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP11369 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms