Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatspereP0DP43 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms