Protein–RNA interactions for Protein: P0C0S6

H2afz, Histone H2A.Z, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afzP0C0S6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2afzP0C0S6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms