Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf1P09925 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf1P09925 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms