Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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