Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxc8P09025 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms