Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Egr1P08046 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms