Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TtrP07309 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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