Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TnfP06804 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnfP06804 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnfP06804 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnfP06804 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnfP06804 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TnfP06804 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TnfP06804 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TnfP06804 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms