Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms