Protein–RNA interactions for Protein: O55047

Tlk2, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlk2O55047 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tlk2O55047 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlk2O55047 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms