Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BckdkO55028 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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