Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cavin1O54724 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms