Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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