Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Kcns1O35173 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Kcns1O35173 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kcns1O35173 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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